数据处理工具
包装说明
该CEST数据处理工具包是为使用商业可用的Matlab程序显示和分析体外和体内CEST成像数据集而开发的。有三个Matlab脚本包含在这个包中:
Matlab函数preprocess.m已经编写了1)基于信噪比的阈值和2)手动定义感兴趣区域(ROI),这些区域将在接下来的步骤中进行分析。
Matlab函数B0map.m通过像素拟合收集的WASSR数据集来生成B0地图。
Matlab函数CEST_processing.m已编写用于对扫频CEST数据集进行定量z谱分析。特别地,执行以下操作:1)在像素方向上纠正B0不均匀性;2)定义ROI的z谱图和MTRasym显示图;3)显示MTRasym地图。
此外,还包括了用于测试的示例数据集,这些数据是在pH从5.0到7.8的肌醇溶液(31.2 mM PBS)模体上获得的。还包括PDF手册。
免责声明
这些Matlab函数是由美国马里兰州巴尔的摩的肯尼迪克里格研究所和约翰霍普金斯医学院开发的。狗万体育官方app下载它们主要是由F.M. Kirby研究中心和Russell H. Morgan放射学和放射科学部门的成员使用的。Matlab软件包是公开可用的,希望它将是有用的,但没有任何保证,甚至没有隐含的保证的适销性或适合于一个特定的目的。旨在帮助对CEST成像感兴趣的磁共振成像领域的研究人员。不打算在临床环境中使用。
引用
如果您使用任何出版物的包处理数据,请引用以下出版物:
Liu G, Gilad AA, Bulte JWM, Van Zijl PCM, Mcmahon MT. high throughput screening of chemical exchange saturation transfer MR造影剂。影像科学与光化学学报2010;5(3):162-170。
有关的其他出版物:
周杰,范子杰。用于化学交换饱和转移(CEST)实验的水饱和度偏移参考(wasr)。医学杂志2009;61(6):1441-1450。
Liu G, Moake M, Har-el Y-e, Long CM, Chan KWY, Cardona A, Jamil M, Walczak P, Gilad AA, sguros G, van Zijl PCM, Bulte JWM, McMahon MT. anti - magnetic chemical exchange saturation transfer lipo质体的体内多色分子MR成像。医学杂志2012;67(4):1106-1113。
Liu G, Chan K, Song X, Zhang J, Gilad AA, Bulte JWM, van Zijl PCM, McMahon MT. NOrmalized磁化率(NOMAR)滤波生成组织选择性对比图。Magn Reson Med 2012。
下载
下载包。
下载截至2019年6月28日
一年 | 114年美洲 | 亚洲/太平洋134 | 欧洲109 | 非洲2 |
2012 | 5 | 3. | 3. | 0 |
2013 | 11 | 15 | 21 | 0 |
2014 | 8 | 14 | 20. | 0 |
2015 | 21 | 12 | 17 | 0 |
2016 | 20. | 22 | 21 | 0 |
2017 | 18 | 26 | 12 | 2 |
2018 | 20. | 26 | 4 | 0 |
2019 | 14 | 16 | 7 | 0 |
总计366 |
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